抗战初期，日军对启东进行两次侵犯后，没有长期占领，这是发展抗日力量的太好时机。1938年5月中旬，启东抗日义勇军加入活动于通如两县交界的特务总队，改编为特务总队第一大队。顾南洲率所部驻刘桥一带，瞿犊仍率所部驻沙家仓附近。几天后，瞿犊原来的四中队改编为特务总队四大队，瞿犊任大队长，改驻曹家镇。7月，年青的共产党员王进受上海地下党组织的派遣到瞿犊的四大队，任大队政训员。他带来了党的关怀和指示，为引导这支部队走上党指引的道路作出不懈的努力。

这时，陆洲舫的江浙边区抗日护航游击总队成员比较复杂，他们与邻近部队还时有摩擦发生。这年7月初，陆洲舫部把驻在久隆、曹家镇的特务总队所属四个中队缴了械。二中队和六中队冲出重围，连夜向南通余西方向转移。在余西，部队又重新整编成一个大队(三个中队)，王兴宇任大队长，瞿犊、顾南洲任副大队长，王澄、姚力两个进步青年担任中队长。不久，通过茅珵的介绍，部队编入国民党通崇海启抗日指挥部，番号为一支队独立大队，保持人事和建制的独立。10月，独立大队改为三大队，由王兴宇任大队长，到海门茅镇一带驻防。而瞿犊和王进则暂离开独立大队，到崇明岛去开展抗日武装斗争。1939年元旦下午，三大队从金沙直奔启东，2日凌晨，与曹持衡、沈坚如部东西夹击，向陆洲舫司令部所在地南清河镇发起进攻，将陆洲舫司令部击垮。元月6日，瞿犊率崇明人民抗日自卫总队的三个中队渡江北来，驻在二厂。茅珵、瞿犊与顾南洲、费一夫等也取得联系，决定成立苏北人民抗日纵队。

队伍改编之后，王澄、姚力的两个中队被派往三和港收税，费一夫、顾南洲等人则忙着与瞿犊等商议纵队的领导人选，一时放松警惕。这时，国民党江苏省政府主席韩德勤派孙倍符、张翼两个保安旅赶往启东。10日，三大队驻地篦箕镇突然被包围，全部枪支被缴，刚改编过来的陆洲舫部也被缴械，人员被驱散。只有王澄、姚力的两个中队因在三和港幸免于难。10日傍晚瞿犊、王进返久隆，不料走到合兴镇时，被张能忍的伏兵扣留。张能忍以瞿、王交出人质为释放的条件，瞿犊、王进严词拒绝，反革命刽子手张能忍深夜将翟、王两人杀害。11日，费一夫也被张能忍杀害于汇龙镇西马路上。

1月15日，部队在二厂镇为瞿、王举行了隆重的追悼大会。3月，上海地下党组织召开瞿犊、王进烈士追悼大会，悼念这两位抗日英雄。一些进步报纸，也登了不少纪念瞿、王烈士的文章。王澄、姚力两个中队，经茅珵介绍，到江苏省常备八团。同年6月，中共江北特委派党员朱群到该部工作。8月，王澄所部改编为鲁苏皖边区游击总指挥部二纵五支队四大队。此后一年多时间里，四大队的王澄、姚力、陶采神等人相继参加中国共产党，1940年2月以后，整个大队都掌握在共产党手中。6月底，郭村战斗打响，四大队在港口暴动，随后进入郭村，参加郭村保卫战，正式加入新四军的行列，编为三纵五团。

此外，当初由瞿犊、王进从崇明带到启海的部队，先受国民党江苏省常备七团丁聚堂部改编，后来假用开小差的办法，逐批回到崇明。1939年春，这批部队在茅珵领导下，组织了崇明人民抗日自卫总队。夏天以后，在中共崇明县临时工作委员会领导下不断发展壮大。1940年8月，该部渡江北上，11月，与东进的新四军会师。

这一时期，海复地区抗日义勇军于1937年11月组建，1938年4月，被国民党海门县常备队收编，士兵逃出。以后几经改编。1940年7月在泰州郭村保卫战之后，该部大多战士也参加了新四军行列。